Box:Oligo C
Location: Freezer next to enzyme freezer
1) ryB
0.1 mM		 2) ryB
10pm/ul		 3)ryA 4)ryC 5) 6) 7) 8)
linker A'
10pmole/ul		 9)
linker A'
230pmole/ul		 10)
linker B
260 pmole/ul
11)
Endo A
0.1 mM		 12)
Endo A
0.2 pmole/ul		 13)
Endo B
0.1 mM		 14)
Endo B
10 pmole/ul		 15)
Endo C
0.1 mM		 16)
Endo C
10 pmole/ul		 17) 18) 19) 20)
21) 22) 23) 24) 25) 26) 27) 28) 29) 30)
31)
TR1
37.7 uMole		 32
TR1
0.2 pmole/ul		 33
TR2
0.2mM		 34) 35
TR3
0.1mM		 36
TR3
10 pmole/ul		 37) 38)Try D 39) 40)
41)

42)

43)

44)

45) 46) 47) 48) 49) 50
Gal4 DBD 3
51

52
53

54

55

56

57

58

59) 60)
61

62

63

64

65

66

67

68) 69) 70)
71
VP16-C		 72
VP16-D		 73) 74) 75) 76) 77) 78) 79) 80)
81
VP16-A		 82
VP16-B		 83
N/Z-A		 84
N/Z-B		 85
Stuffer A		 86
Stuffer B		 87
268//NRE linker A		 88
268//NRE linker B		 89) 90)
91
beta-gal L		 92
beta-gal R		 93
white L		 94
white R		 95
rosy L		 96
rosy R		 97
70w Universal		 98) 99) 100)

Description of contents:

Row 1 (return to top)
1)
  ryB 0.1 mM: GAATCTCGTGGCATGCAATGC, LMPCR, ID61 from Wartik, Second primer for detection of transformant from the rosy side.
2)
  ryB 10pm/ul: 
3)
  ryA 0.1mM: CTATTATTCAATAGAATCTCGTG
4)
  ryC 0.1 mM: CTCGTGGCATGCAATGCATTCTG
5)
  
6)
  
7)
  
8)
  linker A' 10pmole/ul: GCGGTGATTTAAAAGATCTGAATTC, sure pure by DSG 7/99, LMPCR
9)
  linker A' 230 pmole/ul: GCGGTGATTTAAAAGATCTGAATTC, sure pure by DSG 7/99, LMPCR
10)
  linker B 260 pmole/ul: GAATTCAGATC, sure pure by DSG 7/99, LMPCR
Row 2 (return to top)
11)
  Endo A 0.1 mM: LMPCR, CAGTAGTTGCAGTTGATTTAC, ID107 from Wartik, First primer for LMPCR of endogenous hsp70
12)
  Endo A 0.2 pmole/ul
13)
  Endo B 0.1 mM: LMPCR, GCAGTTGATTTACTTGGTTGC, ID108 from Wartik, Second primer for LMPCR of endogenous hsp70
14)
  Endo B 10 pmole/ul:
15)
  Endo C 0.1 mM: LMPCR, GCAGTTGATTTACTTGGTTGCTGG, ID109 from Wartik, Third primer for LMPCR of endogenous hsp70
16)
  Endo C 10 pmole/ul:
17)
  
18)
  
19)
  
20)
  
Row 3 (return to top)
21)
  
22)
  
23)
  
24)
  
25)
  
26)
  
27)
  
28)
  
29)
  
30)
  
Row 4 (return to top)
31)
  TR1 37.7 uMole: ACGACGTTGTAAAACGAC for LMPCR
32)
  TR1 0.2 pmole/ul: ACGACGTTGTAAAACGAC for LMPCR
33)
  TR2 0.2mM: GTAAAACGACGGGATCGATTCC for LMPCR
34)
  
35)
  TR3 0.1mM: CGACGGGATCGATTCCAATAGGC for LMPCR
36)
  TR3 10 pmole/ul: CGACGGGATCGATTCCAATAGGC for LMPCR
37)
  
38)
  TryD 0.8mM: CGAAAATATAAGCTCAATC
39)
  
40)
  
Row 5 (return to top)
41)
  
42)
  
43)
  
44)
  
45)
  
46)
  
47)
  
48)
  
49)
  
50)
  Gal4 DBD 3: GAG ACC TTT TGG TTT TGG GAG AGT AG
Row 6 (return to top)
51)
  
52)
  
53)
  
54)
  
55)
  
56)
  
57)
  
58)
  
59)
  
60)
  
Row 7 (return to top)
61)
  
62)
  
63)
  
64)
  
65)
  
66)
67)
  
68)
  
69)
  
70)
  
Row 8 (return to top)
71)
  VP16-C: CAAGTTCGCGCGCCTCGACAAC, primer for sequencing VP16 insert in pCS 268//NRE-VP16, on order 2/9/02
72)
  VP16-D: GTCGAGGCTGATCAGCGAGCTCTAG, , primer for sequencing VP16 insert in pCS 268//NRE-VP16, on order 2/9/02
73)
  
74)
  
75)
  
76)
  
77)
  
78)
  
79)
  
80)
  
Row 9 (return to top)
81)
  VP16-A: gatccttaagcgcgtacagccgcgcgcgta, PCR VP16 activation domain with AflII and XbaI ends for insertion into Zif268//NRE.
82)
  VP16-B: gaccggcgctcagctggaattaggc, PCR VP16 activation domain with AflII and XbaI ends for insertion into Zif268//NRE.
83)
  N/Z-A: tcgagaagggttcaggcgtgggcg, insertion of binding site for Zif268//NRE into XhoI site of pGEM TRE5 70
84)
  N/Z-B: tcgacgcccacgcctgaacccttc, insertion of binding site for Zif268//NRE into XhoI site of pGEM TRE5 70
85)
  Stuffer A: CTAGAAGGTACCAGC, replaces the hsp70 promoter as an XbaI/NotI piece in p70w.  This will facilitate future subcloning of promoters.
86)
  Stuffer B: GGCCGCTGGTACCTT, replaces the hsp70 promoter as an XbaI/NotI piece in p70w.  This will facilitate future subcloning of promoters.
87)
  268//NRE linker A: GATCTCCCGGGAAGCTAC, linker for inserting 268//NRE-VP16 into pCaSpeR-hs.
88)
  268//NRE linker B: GATGGTAGCTTCCCGGGA, linker for inserting 268//NRE-VP16 into pCaSpeR-hs.
89)
  
90)
  
Row 10 (return to top)
91)
  beta-gal L: ccagtcaggctttctttcac, Liu's primer for ChIP'ing transgene (Pedro's Tm = 57.2)
92)
  beta-gal R: gcatcagcaagtgtatctgc, Liu's primer for ChIP'ing transgene (Pedro's Tm = 56.7)
93)
  white L:  cgctggataggagttgagat, Liu's primer for ChIP'ing transgene (Pedro's Tm = 56.6)
94)
  white R: ctgaagaagctgtcgcagaa, Liu's primer for ChIP'ing transgene (Pedro's Tm = 59.2)
95)
  rosy L: acaaggacttaacggagcac, Liu's primer for ChIP'ing transgene (Pedro's Tm = 56.6)
96)
  rosy R: ataggacttgagctcgatgg, Liu's primer for ChIP'ing transgene (Pedro's Tm = 56.6)
97)
  70w Universal: GCTTCGTCTACGGAGCGACA, anneals near the transcription start and can be used with TR primers to amplify 70w derivatives.
98)
  
99)
  
100)
  
(return to top)